终末消毒是专业性较强、感染风险较大的工作。主要是在传染源离开疫源地后，对疫源地进行一次彻底消毒。目的是完全杀灭病人遗留在居室和各种物体表面上存活的病原体。消毒人员还通过喷洒和擦拭的方式，对驻在地区家庭、公共区域、楼道、电梯、交通工具等人员密切接触的物体表面、墙壁、地面、空间、餐（饮）具等进行预防性消毒处理。
终末消毒、预防性消毒和随时消毒均是切断病毒传播途径，预防控制传染病传播流行的重要措施。
自2月5日前线防控组驻武汉市环境卫生与消毒专家工作队成立以来，工作队深入感染区了解确诊、密接人群等各类问题，制定了《普通人居家生活十条》《发热、疑似病人居家生活十条》等技术指南；对华南海鲜市场、监狱、养老院等重点场所进行调查，科学指导消毒及环境卫生学处置；深入街道和社区指导基层环境卫生消毒，针对现场问题提出解决方案。
新的目标：培养一支不走的公共卫生队伍
湖北省除武汉市以外地区已解除离鄂通道管控，武汉市将于4月8日起解除离汉离鄂通道管控措施。
随着湖北和武汉经济社会生活的恢复，社会从相对封闭静态转向相对开放动态，人员流动性加大和人员集聚带来的疫情反弹风险增加。同时在全球范围，疫情正处于快速蔓延阶段，武汉作为国家中心城市，拥有不少外资企业和高等院校，防范境外疫情输入的任务也十分繁重。
筑牢疫情防控堡垒，需要一支专业的公共卫生队伍。3月22日，国家卫健委联合湖北疫情防控指挥部开展湖北省疫情防控“疾控大培训”。